More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1551 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  38.22 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  53.47 
 
 		 145 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  35.82 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  27.78 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.84 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  24.71 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  23.44 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  25 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.16 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  37.93 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  28.93 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  22.8 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 388 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  21.74 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  22.17 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.92 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  21.33 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.92 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>