More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1611 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  81.55 
 
 
206 aa  341  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  81.55 
 
 
206 aa  337  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
218 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  34.34 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
212 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  31.47 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  51.85 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
310 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
228 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  32.65 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
216 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
192 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
216 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 
248 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  38.16 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
307 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  45.1 
 
 
198 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
195 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
244 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
497 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
187 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
196 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
215 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
217 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
203 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 
216 aa  51.6  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
192 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 
246 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
192 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  30.63 
 
 
145 aa  51.6  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
125 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  46.3 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
394 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  43.08 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
376 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
394 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
394 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 
278 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  50 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  38.71 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>