More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0496 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  36.27 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  36.98 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  33.51 
 
 		 250 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 257 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  36.5 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 251 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 208 aa  95.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  35.38 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 226 aa  88.2  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 225 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  31.19 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  27.92 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  28.27 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.5 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  29.95 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.46 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  29.7 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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