More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6592 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  72 
 
 		 224 aa  286  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  46.7 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 540 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 202 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.14 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  32.37 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 228 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.93 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  26.21 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  26.55 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
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NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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