More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2115 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  440  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 210 aa  208  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  49.28 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  50.49 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  51.71 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  48.36 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 234 aa  174  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  33.65 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  35.6 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 200 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 259 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  34.18 
 
 		 234 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  31.65 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  28.06 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  35.11 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  28.5 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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