More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1400 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  92.02 
 
 		 213 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  37.69 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  36.02 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  35.97 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  36.31 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.32 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.91 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.88 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 251 aa  85.1  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.09 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.46 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.32 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  28.71 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  31.71 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  30.15 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  25.15 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  33.63 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.07 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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