More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1944 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 212 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  47 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  46.67 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  52.53 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 210 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  43.56 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  42.72 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  43.07 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.7 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  36.98 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  33.94 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  35.82 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 208 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.51 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  33.5 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 209 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  29.91 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  31 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  89  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  28.5 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 192 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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