More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2416 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  54.59 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  47.64 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  97.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  35.83 
 
 		 219 aa  88.2  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 244 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  33.16 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  28.12 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  28.43 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  28.72 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.65 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
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NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
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NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.17 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_00480  transcriptional regulator TetR/acrR family  31.65 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  26.52 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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