More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5077 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  413  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  50.5 
 
 		 204 aa  161  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  45.73 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  45.64 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 245 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 227 aa  91.7  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  35.18 
 
 		 220 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.16 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.93 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.86 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  24.88 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  31.16 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  29.24 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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