More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5925 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 205 aa  187  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  29.21 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  30.39 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  32.97 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  31.5 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.71 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  49.15 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  34.29 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
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