More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1222 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  87.25 
 
 
204 aa  359  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  90.77 
 
 
195 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  75.49 
 
 
217 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 
217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 
217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  74.51 
 
 
217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 
211 aa  305  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  70.1 
 
 
212 aa  273  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  77.44 
 
 
208 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  76.41 
 
 
208 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  64.14 
 
 
203 aa  254  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  59.39 
 
 
202 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  57.95 
 
 
200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  54.82 
 
 
204 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
210 aa  208  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  54.31 
 
 
207 aa  201  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
202 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
202 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  42.63 
 
 
203 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 
203 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
201 aa  134  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  35.57 
 
 
204 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  32.84 
 
 
205 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  30.77 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
212 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
198 aa  104  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 
202 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  31.66 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.91 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.96 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  49.33 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.62 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  28.48 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
228 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
244 aa  61.6  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
217 aa  61.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  36.72 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  31.16 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
247 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
247 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>