More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0297 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  83.25 
 
 		 203 aa  353  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  81.77 
 
 		 203 aa  350  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  81.28 
 
 		 203 aa  347  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 211 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
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NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  37.88 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
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NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  33.17 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  32.14 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.3 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  35.59 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.68 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
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NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  38.3 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
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