More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00486 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  100 
 
 		 224 aa  465  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  36.32 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  35.29 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 188 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.28 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.11 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  28.43 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 213 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 213 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  28 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  30.36 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.26 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  32.56 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  26.19 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  32.62 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
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