More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4446 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  93.33 
 
 		 210 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  91.9 
 
 		 210 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  90.48 
 
 		 210 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  82.78 
 
 		 209 aa  358  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  83.25 
 
 		 215 aa  354  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  84.29 
 
 		 219 aa  345  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  31.95 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.5 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  32.7 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  28.08 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.5 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.95 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  27.08 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  26.24 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>