More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3394 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2999  TetR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.03228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0679  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  31.09 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  24.12 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  30.18 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  32.81 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  27.46 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.95 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  24.26 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 191 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 266 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
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NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  25.91 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_013093  Amir_1125  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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