More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2925 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  537  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  92.51 
 
 		 228 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  56.44 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 214 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 205 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 192 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 209 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.86 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 206 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 206 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 207 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 209 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 208 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 211 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.95 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 225 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 216 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 211 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 225 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  31.03 
 
 		 224 aa  85.5  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.74 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.35 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  34.15 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  29.85 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.93 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 206 aa  72  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
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NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 219 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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