More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3682 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 540 aa  1067    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  38.77 
 
 		 322 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  37.2 
 
 		 335 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  35.98 
 
 		 326 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  36.06 
 
 		 349 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  33.85 
 
 		 331 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  36.39 
 
 		 330 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  35.87 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  35.87 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  36.14 
 
 		 326 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  34.95 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  38.11 
 
 		 353 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  37.12 
 
 		 322 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  35.15 
 
 		 338 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  35.15 
 
 		 345 aa  170  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  35.17 
 
 		 325 aa  170  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  37.54 
 
 		 329 aa  170  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  33.94 
 
 		 349 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  34.24 
 
 		 349 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  34.85 
 
 		 343 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  36.92 
 
 		 333 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  33.43 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  35.31 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  33.54 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  32.42 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  33.43 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  34.77 
 
 		 331 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  35.45 
 
 		 344 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  40.74 
 
 		 323 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  35.69 
 
 		 352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  36 
 
 		 333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  34.85 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  35.54 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  35.17 
 
 		 355 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  34.13 
 
 		 378 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  34.73 
 
 		 345 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  37.61 
 
 		 333 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  34.04 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  33.84 
 
 		 334 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  34.55 
 
 		 326 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  35.95 
 
 		 351 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  35.95 
 
 		 351 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  34.35 
 
 		 349 aa  163  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  33.43 
 
 		 343 aa  163  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  34.73 
 
 		 345 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  34.73 
 
 		 345 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  34.35 
 
 		 349 aa  163  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  34.73 
 
 		 345 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  33.93 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  35.56 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  36.25 
 
 		 351 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  35.33 
 
 		 345 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  34.24 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 344 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  35.03 
 
 		 345 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  36.39 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  36.31 
 
 		 346 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 344 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  35.29 
 
 		 327 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  34.45 
 
 		 361 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  35.15 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  31.93 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 342 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  34.56 
 
 		 344 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  35.58 
 
 		 349 aa  160  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  34.47 
 
 		 342 aa  160  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  32.93 
 
 		 340 aa  160  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  35.06 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  35.26 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  33.93 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  34.65 
 
 		 326 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  34.15 
 
 		 326 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  33.54 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  35.05 
 
 		 332 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 325 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 222 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 349 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  33.94 
 
 		 333 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  34.76 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  34.16 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  35.28 
 
 		 332 aa  158  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  34.76 
 
 		 351 aa  158  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  33.84 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  43.12 
 
 		 340 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  34.25 
 
 		 344 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  32.53 
 
 		 349 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  35.95 
 
 		 370 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  32.84 
 
 		 368 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  34.44 
 
 		 332 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  34.76 
 
 		 326 aa  157  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  34.46 
 
 		 331 aa  157  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.54 
 
 		 324 aa  156  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  33.54 
 
 		 326 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  34.35 
 
 		 352 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  35.19 
 
 		 334 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  36.34 
 
 		 326 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.84 
 
 		 324 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  37.24 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>