More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 259 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
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NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  33.85 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.77 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
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NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  32.35 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 213 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.82 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
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