More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3113 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  34.87 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  33.67 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  28.87 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.05 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  97.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  33.5 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.37 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.89 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  22.56 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31.5 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  33.95 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
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NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
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NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
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NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 424 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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