More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0532 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 424 aa  867    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 214 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 221 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.15 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 211 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 230 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 224 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  21.85 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 225 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  36.75 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 213 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1421  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 190 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  25.88 
 
 		 264 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 255 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 207 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 233 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 215 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 207 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 208 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 222 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 200 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  34.91 
 
 		 193 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 203 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 198 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  24.52 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 200 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 184 aa  54.7  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 208 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 220 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 208 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>