More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1511 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  49.76 
 
 		 220 aa  205  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  49.76 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  47.44 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  50.76 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 212 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 213 aa  171  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  41.06 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  39.59 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 231 aa  138  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  36.27 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 192 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  34.9 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31.98 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.41 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.6 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.27 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  32.12 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  27.46 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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