More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4585 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  94.09 
 
 		 220 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  93.64 
 
 		 220 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  68.98 
 
 		 212 aa  292  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  70.56 
 
 		 221 aa  276  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 210 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  47 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  42.56 
 
 		 216 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 231 aa  147  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  34.7 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  38.28 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  40.19 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  37.69 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  36.22 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 237 aa  98.2  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  29.44 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 257 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  30.46 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.89 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.28 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  34.96 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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