More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1767 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  84.21 
 
 		 207 aa  337  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2577  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.84 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 220 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  23.44 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  26.15 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  25.59 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
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NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
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NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
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NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  52.83 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.39 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
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