More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2103 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 209 aa  360  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 258 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2577  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.82 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.37 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  31.69 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  26.29 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  52.83 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.8 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
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NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  30.28 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
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