More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3666 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  95.7 
 
 		 187 aa  352  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  89.78 
 
 		 192 aa  333  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  89.78 
 
 		 192 aa  333  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  89.78 
 
 		 192 aa  333  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  83.33 
 
 		 187 aa  314  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  71.51 
 
 		 189 aa  264  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  64.89 
 
 		 199 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  62.18 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  67.57 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  57.53 
 
 		 186 aa  204  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  37.97 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.07 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  26.04 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  34.62 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  25.29 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  40.68 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 346 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>