More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1719 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 218 aa  168  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  37.96 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  38.66 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  29.14 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  29.14 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  29.14 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  29.14 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  29.14 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  28.48 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  28.48 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0178  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.58 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  27.13 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>