More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5436 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  52.45 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  45.6 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  51.16 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  43.75 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  34.91 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  43.71 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  50.82 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  33.07 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  41.67 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  41.67 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  41.67 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  41.67 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  41.43 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 250 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  38.81 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>