More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0646 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  25.84 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  33.09 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  48.21 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  32.32 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.46 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  46.3 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  46.3 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  47.27 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 398 aa  54.7  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  31.01 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 376 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>