More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4165 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  76.17 
 
 		 197 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  74.87 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  73.44 
 
 		 197 aa  280  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  67.71 
 
 		 198 aa  272  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 197 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  50.54 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  54.12 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  51.04 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 195 aa  174  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  51.53 
 
 		 201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 198 aa  95.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 211 aa  84.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  33.67 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  32.65 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  33.91 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  42.19 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>