More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2551 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  47.54 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  46.03 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  31.67 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  43.1 
 
 		 234 aa  51.2  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  38.89 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  38.89 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  57.41 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  35.96 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  31 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>