More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3550 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 374 aa  733    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  62.12 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2117  transcriptional regulator, TetR family  45.82 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  42.7 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  45.83 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 204 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 202 aa  57  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 198 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  42.86 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 217 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 207 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  38.55 
 
 		 246 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 197 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 198 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 206 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 198 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 211 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 203 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 203 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 226 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 203 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  42.47 
 
 		 197 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 196 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 221 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 201 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 201 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 225 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 195 aa  53.1  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 204 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 206 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 234 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 192 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  42.11 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 217 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  39.02 
 
 		 239 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  39.06 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 216 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 203 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 193 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 195 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 203 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 204 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 231 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 233 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 218 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  38.6 
 
 		 213 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 196 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 230 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 222 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 221 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 228 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 195 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 214 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>