More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2970 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  92.86 
 
 		 196 aa  360  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 197 aa  204  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  56.59 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  58.03 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  58.03 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  56.12 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  57.84 
 
 		 196 aa  191  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 197 aa  187  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  55.5 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  52.88 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  57.84 
 
 		 201 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  95.5  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 225 aa  87.8  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 205 aa  87.8  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  27.75 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  37.87 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  31.61 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.04 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.7 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  42.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  42.86 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  28.48 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>