More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3183 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  63.37 
 
 		 220 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  63.45 
 
 		 217 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 197 aa  254  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 197 aa  250  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 218 aa  244  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 330 aa  241  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  58 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  57.65 
 
 		 205 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  54.87 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  54.19 
 
 		 215 aa  224  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  53.5 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  52.68 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  53.88 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 317 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  55.78 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  50.47 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  52.28 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  52.74 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  52.74 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  53.61 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  53.89 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.43 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  28.43 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  28.79 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>