More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4456 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  55.9 
 
 		 201 aa  224  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 209 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 215 aa  218  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 204 aa  218  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  42.72 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 221 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 228 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 237 aa  84.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.6 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  44.59 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  28.04 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>