More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30200 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  77.88 
 
 		 211 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  74.65 
 
 		 218 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  79.49 
 
 		 205 aa  323  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  74.38 
 
 		 245 aa  308  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  66.83 
 
 		 205 aa  274  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 330 aa  272  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  65.64 
 
 		 200 aa  271  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  63.98 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  65.67 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  64.85 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  61.08 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  61.08 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  61.08 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  62.19 
 
 		 227 aa  259  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  61.65 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  62.02 
 
 		 215 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  62.21 
 
 		 317 aa  257  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  59.11 
 
 		 217 aa  254  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  59.43 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  59.39 
 
 		 197 aa  248  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 197 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  58.22 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  61.42 
 
 		 207 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  56.78 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  56.41 
 
 		 199 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  50.47 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 224 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.71 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  30.58 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  29.41 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>