More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7816 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  65.83 
 
 
206 aa  264  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  62.93 
 
 
212 aa  262  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  64.65 
 
 
206 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  64.32 
 
 
222 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  64.62 
 
 
212 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  64.43 
 
 
206 aa  252  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  65.46 
 
 
195 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  60.41 
 
 
216 aa  242  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
238 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  59.3 
 
 
215 aa  238  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  58.46 
 
 
206 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  58.16 
 
 
221 aa  231  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  55.66 
 
 
214 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  56.57 
 
 
221 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  62.92 
 
 
212 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 
228 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  52.55 
 
 
219 aa  205  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  51.53 
 
 
223 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  48.99 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  48.99 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  48.99 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
224 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  46.67 
 
 
237 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  40.43 
 
 
218 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  36.44 
 
 
254 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 
222 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
248 aa  104  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.78 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  29.07 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 
203 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  30.57 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.78 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
330 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  25.82 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  51.61 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  27.13 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>