More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0024 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  94.82 
 
 		 193 aa  337  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  71.74 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  48.13 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  51.48 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  48.09 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 215 aa  147  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 220 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  51.65 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  53.89 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  48.47 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  47.4 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  43.11 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  44.68 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 220 aa  101  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 400 aa  98.6  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 363 aa  97.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 425 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 309 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  34.42 
 
 		 403 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  34.64 
 
 		 390 aa  81.3  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 385 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 424 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 412 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 406 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 391 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  29.91 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  34.38 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  28.68 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.55 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  26.23 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  51.79 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>