More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0564 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.34 
 
 		 237 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 228 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 228 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 221 aa  85.1  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  30.57 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.04 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  37.93 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  24.63 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  38.14 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  25.81 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>