More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1434 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  70.5 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  61.85 
 
 		 194 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  54.14 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  53.63 
 
 		 197 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  48.59 
 
 		 211 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  34.08 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.93 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  24.89 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  31.02 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.21 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  30.41 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  29.61 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  27.47 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  30.33 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>