267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23490 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  50.69 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  43.89 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  39.29 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  37.7 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  47.93 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 275 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  27.67 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  35.16 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  31.86 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1198  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.91 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  33.9 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  46 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  28.44 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 268 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.97 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  45.83 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  32.65 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  32.65 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>