78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 217 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 226 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  40.17 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  45.13 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  36.76 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  29.53 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  41.59 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  26.41 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  28.64 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 196 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.14 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 197 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 216 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  25.29 
 
 		 197 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 195 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>