More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1567 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0544  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000992558 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  26.57 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  31.97 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  28.79 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 203 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 203 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2043  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  28.79 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  28.79 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  28.79 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  24.53 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 175 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  27.21 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 218 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 220 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 198 aa  48.9  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 181 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 226 aa  48.9  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>