171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0103 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  87.18 
 
 		 235 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  87.18 
 
 		 235 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  87.18 
 
 		 235 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  88.99 
 
 		 227 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  80 
 
 		 234 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  48.86 
 
 		 246 aa  213  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 275 aa  131  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 213 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  35.56 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  31.96 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  33.52 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  26.92 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  24.49 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  25.14 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  28.86 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  39.62 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 324 aa  45.1  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  24.34 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>