More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1153 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 246 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 217 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 217 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  30.52 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  50 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 218 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  47.06 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  30.83 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  24.23 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  26.97 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  31.69 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  49.18 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  29.67 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40.62 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 461 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  22.39 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 185 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 318 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 318 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 318 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 318 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>