More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3159 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  61.27 
 
 		 215 aa  254  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  48.7 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  34.24 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  47.52 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  31.18 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  31.05 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  42.03 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  52.54 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 125 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  55.26 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 461 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 372 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  34.88 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  61.54 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 332 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  35.44 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 335 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  36.23 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  46.3 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  41.67 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  38.33 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  31.94 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  39.22 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>