More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1682 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  35.6 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 266 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  51.28 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  42.74 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  37.01 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  31.45 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  31.89 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  38.67 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  37.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  37.33 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  34.67 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 180 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 275 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  37.33 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  37.33 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  31.51 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  37.33 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  30.58 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  37.33 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  40.28 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  38.55 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  32 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  39.66 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  38.16 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>