More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2036 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  31.28 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  46.81 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.52 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  49.06 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  31.58 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  36.96 
 
 		 246 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  23.68 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 414 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>