More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1906 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  42.4 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  44.2 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 221 aa  85.1  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  64.06 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  72  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  39.1 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  50 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  39.02 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  40.35 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  36.21 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  44.78 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  39.47 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  45.83 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  56.82 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  43.75 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  45.33 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  37.01 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  37.01 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  56.52 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  51.72 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  47.89 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  47.46 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 258 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>