More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2758 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
217 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  83.56 
 
 
266 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  54.59 
 
 
193 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  45.53 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  39.53 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  43.36 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  51.14 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  38.46 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
221 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  41.44 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  56.45 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
233 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  46.67 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
205 aa  58.5  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  23.19 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.65 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
232 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.33 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  24.76 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  31.68 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
291 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal 
 
 
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NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246252 
 
 
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NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  23.7 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
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NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
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NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  46.15 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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