More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2204 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  100 
 
 
235 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  60.28 
 
 
218 aa  279  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  58.05 
 
 
217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  40.85 
 
 
220 aa  189  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  40.89 
 
 
218 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
232 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
233 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
233 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
233 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
233 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
232 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  52.44 
 
 
106 aa  86.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
198 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 
200 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
263 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  31.71 
 
 
208 aa  58.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  26.41 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.46 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  38.57 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
199 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
207 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  39.44 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
266 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 
217 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  24.79 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 
203 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
196 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
242 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 
196 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
189 aa  52  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
283 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
213 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 
244 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  39.19 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0951056 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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